速卖通的全托管店铺在遇到三次严重侵权的情况下，保证金的退还情况取决于是否存在违规被扣保证金的情况。

如果商家在申请入驻速卖通时交纳了保证金，并且在退出经营时没有违规被扣保证金的情况，那么保证金是可以全额退回的。保证金的解冻规则是在账号退出类目30天后，建议在第31天查看支付宝余额，因为支付宝的余额不会变多，只是保证金从冻结变成可用状态。如果有严重违规，可能会扣除保证金。