在FNAC.PT平台上设置和管理物流配送方式需要按照以下步骤进行：

1. 登录FNAC卖家中心账户；2. 点击左侧菜单栏中的“物流配送方式”选项；3. 点击“添加”按钮，选择您要添加的物流配送方式（例如：自备物流或使用平台备选物流等）；4. 填写物流方式的相关信息，如发货时间、运费等；5. 点击“保存”按钮，保存您的物流配送方式。

在添加物流配送方式后，您可以使用新添加的方式作为订单发货的默认选项。同时，您还可以根据订单的实际情况灵活调整物流配送方式、运费等信息，以满足客户的需求。如果您有任何疑问或者需要进一步帮助，您可以联系FNAC.PT的客服人员，他们将会为您提供详细的指导。