亚马逊河在巴西流经了巴西亚马逊州的马淄斯市。
在这里巴西政府建立了亚马逊河中心保护区,这个保护区位于巴西亚马逊州的马瑙斯市西北部大约200公里处。亚马逊河中心保护区是亚马逊盆地(总面积超过六百万亩)中最大的保护区,也是世界上生物最多样化的区域之一。