如果亚马逊店铺总余额是负数，首先需要确定负数的原因。

如果是因为退款、退货或者客户投诉导致的，则需要及时处理该问题并跟进解决。如果是因为账务出现错误或亚马逊平台的技术问题导致的，则需要及时联系亚马逊客服进行解决。此外，还需要对店铺的财务状况进行全面评估，找出原因并采取措施，以避免类似问题再次出现。