亚马逊河的支流有:埃纳河、普鲁斯河、阿普里马克河、乌卡亚利河、潘帕斯河、帕奇特阿河、塔皮切河、雅普腊河、莫罗纳河、瓦亚加河、乌鲁班巴河、帕斯塔萨河、特龙贝塔斯河、科连特斯河、塔帕若斯河等很多主要支流,还有一些比较小的支流:阿塔夸里河、特费河、库鲁阿河、库鲁阿乌纳河、纳奈河、阿瓦蒂巴拉那河、巴拉那科佩亚河、科阿里河等。
亚马孙河右岸最大支流马代拉河,长3,240公里,流域面积 138万平方公里,年平均流量31,400立方米/秒。长度按世界大河排列可居第17位;超过欧洲所有外流河,相当莱茵河长度两倍半,在世界所有河流支流中,位居第一。该河源出玻利维亚 安第斯山地,中下游流经热带多雨地区,上源有高山冰雷融水辛卜 给,流量极丰,相当密西西比河1.6倍。流程多险滩、急流、瀑 布。河宽一般700—900米9中、下游在巴西境内。为玻利维亚和秘鲁通向大西洋的航道。