拼多多的直营店和普通店铺有以下几点区别：

1. 所属关系：拼多多直营店是由拼多多公司直接负责经营和管理的店铺，而普通店铺则是由第三方商家自行运营的。

2. 商品价格：拼多多直营店的商品价格相对较低，因为拼多多可以通过直接采购和减少中间环节的方式控制成本，并直接向消费者销售商品；而普通店铺的商品价格相对较高，因为商家需要支付平台相关服务的费用，同时还需要考虑到自身成本和利润。

3. 商品品质：拼多多直营店的商品品质相对较高，因为拼多多会对自己销售的商品进行质量把控和监管；而普通店铺的商品品质参差不齐，需要消费者自己进行辨别和选择。

4. 售后服务：拼多多直营店的售后服务比较有保障，因为拼多多有完善的售后服务系统和政策；而普通店铺则需要依赖商家的售后服务能力。

5. 信誉评价：拼多多直营店的信誉评价相对较高，因为其由拼多多公司直接管理并有较高的监管标准；而普通店铺的信誉评价参差不齐，需要消费者自己进行辨别和选择。需要注意的是，拼多多的直营店不一定就是所有商品的最优选择，具体选择哪种店铺还需根据自身需求和商品质量价格等多方面因素来考虑。